社区2006年11月创立时开放注册，任何人均可免费注册。自2007年1月29日后，社区改為实行邀请注册，须输入由現会员用贡献值购买的邀请码方可注冊。2011年6月，其机房发生大火，部分服务器在大火中损毁，部分资源及会员资料丢失，同月6日，社区开放注册两天，两天内注册会员超过13万，並因而再度关闭开放注册。现在草榴社区仍需邀请码才能注册，在很多技术讨论区的帖子中会有老会员以发“福利”的形式发放邀请码，但基本都很快被抢光。

2015年5月17日始，草榴社区因为数据丢失无法正常访问。2015年5月18日，草榴社区出现消息指，称因为大炮攻击可能会导致网站永久关闭。[3][4]随后官方辟谣称这条消息是谣传，网站仅仅是在整理数据。

2019年7月16日，中国大陆各大新闻媒体报道《草榴社区4名骨干落网》，其实是在草榴社区上活跃的原創圖片分享团体“CL分享团”的4名运营人员被抓[5]。